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Cancer Metast√°sico

Revolucionario Avance en la Investigaci√≥n del C√°ncer Metast√°sico: El Conjunto de Datos NYUMets Abre Nuevas Perspectivas El c√°ncer metast√°sico, una de las formas m√°s letales y desafiantes de la enfermedad, ha encontrado un nuevo oponente en la colaboraci√≥n entre la NYU Langone Medical Center y l√≠deres tecnol√≥gicos en el campo de la inteligencia artificial y […]

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Mar

Machine Learning

En las pr√≥ximas semanas vamos a indagar sobre diversos aspectos que rodean Machine Learning. Vivimos en una sociedad cada vez m√°s tecnol√≥gica en la que el machine learning ha ido adquiriendo mayor importancia. Aunque no seamos conscientes de ello, cada vez prevalece m√°s este tipo de tecnolog√≠a como cuando nuestro m√≥vil reconoce llamadas de spam, […]

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Mar

Variant Calling

¬ŅQu√© es el Variant Calling? Se define como el proceso mediante el cual se identifican variantes a partir de datos de secuenciaci√≥n. El proceso que se lleva a cabo groso modo de la siguiente forma: Obtener datos en formatos FASTQ de los datos de secuenciaci√≥n de genoma o exoma completo. Alineamiento de las secuencias a […]

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Mar

An√°lisis de interacciones en el docking molecular

La semana pasada aprendimos a llevar a cabo docking macromolecular entre la prote√≠na p53 y¬† MDM2. En la semana de hoy vamos a llevar a cabo un estudio previo al del docking molecular, vamos a analizar la interacci√≥n entre la prote√≠na MDM2 y el ligando Benzodiacepina. ¬ŅQu√© herramientas se van a emplear? PDBSum. Base de […]

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Mar

Docking Macromolecular

Docking Macromolecular La semana pasada se realiz√≥ Blind Docking Prote√≠na-Ligando la interacci√≥n de la prote√≠na Cdc25B con el ligando menadiona. En cambio, esta semana vamos a aprender a hacer Docking Macromolecular.   ¬ŅQu√© herramientas se van a emplear? HDOCK (http://hdock.phys.hust.edu.cn/), un servidor web gratuito que permite realizar docking prote√≠na-prote√≠na as√≠ como prote√≠na-ADN/ARN.   UFC Chimera, […]

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Mar

Ampliamos nuestro servicio de secuenciación

Desde BKL estamos orgullosos de anunciar la reciente puesta a punto de un nuevo equipo Illumina con el que seguimos ampliando nuestros servicios de secuenciaci√≥n. Gracias a lo cual afianzamos nuestra posici√≥n en el mercado y nos aseguramos de seguir en la vanguardia nacional en cuanto a bioinform√°tica y secuenciaci√≥n se refiere. Con este nuevo […]

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Mar

Exploración de los resultados de Swiss Target Prediction

¬ŅQu√© vamos a ver hoy? En esta entrada vamos a llevar a cabo una aproximaci√≥n de docking macromolecular para comprobar la interacci√≥n entre nuestro ligando menadiona y la prote√≠na Cdc25B. Se ha de comprobar, buscando en el portal PDB (https://www.rcsb.org) si se tiene recogida la estructura molecular de esta prote√≠na, buscando bien sea su nombre […]

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Mar

Predicción de una diana molecular con Swiss Target Prediction

¬ŅQue vamos a ver hoy? En las entradas anteriores hemos visto c√≥mo realizar y visualizar un docking molecular en ‚ÄúSwissDock‚ÄĚ, empleando un servidor web gracias as su manejo sencillo e intuitivo. En el d√≠a de hoy vamos a aprender c√≥mo podemos predecir una diana o ‚Äútarget‚ÄĚ para un ligando determinado y c√≥mo llevar a cabo […]

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Mar

Introducción al RNA-seq

¬ŅQue es el RNA-seq? El RNA-seq es una t√©cnica de an√°lisis del transcriptoma. Aunque a d√≠a de hoy existen muchas variantes de la misma, en general se puede describir como la secuenciaci√≥n de ARN mediante tecnolog√≠a de secuenciaci√≥n masiva, las conocidas NGS, de tal forma que se obtenga informaci√≥n acerca de la secuencia y cantidad […]

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Mar

Presentación Blog BKL

¬ŅCu√°l es nuestro objetivo? Desde BKL queremos compartir tanto el conocimiento como la curiosidad que siempre nos han caracterizado, acerca de temas tan actuales como relevantes, entre los que podr√©is encontrar bioinform√°tica, secuenciaci√≥n, bioeconom√≠a o bioempresas. Con esto no queremos sino seguir construyendo una comunidad centrada en la divulgaci√≥n y el amor por la ciencia. […]