Secuenciación del amplicoma 16S/18S/ITS

Este sistema de secuenciación parte de una PCR previa en la que se amplifica un fragmento del ADN ribosómico, este tiene intercaladas secuencias hipervariables con otras mas conservadas, de este modo se consigue una clasificación taxonómica muy consistente con secuencias relativamente cortas. Dado que secuenciamos un pequeño fragmento (unos 500pb) y no el gen ribosómico/genoma entero, a los elementos identificados se les da el nombre de OTUs.

Una vez se conozca la composición microbiana del medio se pueden llevar a cabo multitud de análisis de diversidad que arrojen luz sobre las variaciones que experimenta la microbiota a lo largo de las distintas condiciones experimentales.

 

Aplicaciones:

  • Identificación de especies
  • Análisis de microbiotas ambientales/humanas
  • Estudio de la diversidad de la microbiota

 

 

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